Dane, których dotyczyć będzie analiza są prawdopodobnie najbardziej znanym, klasycznym przykładem zastosowania kartografii w epidemiologii. Obrazują epidemię cholery w Londynie w roku 1854. Mapę
przedstawiającą zakres epidemii sporządził lekarz, odkrywca przyczyny epidemii, uznany za jednego z twórców epidemiologii –John Snow. Współrzędne punktów, które posłużyły do wyrysowania map, pochodzą
z oryginalnej mapy stworzonej przez Johna Snowa, która została zdigitalizowana przez Rusty Dodson z US National Center for Geographic Information Analysis (http://ncgia.ucsb.edu/Publications/Software/cholera/) a następnie przedstawiona w metrach
Mapa deaths zawiera informacje o lokalizacji 578 punktów (śmierci z powodu cholery) w Soho
–jednej z dzielnic Londynu
Mapa pumps zawiera informacje o lokalizacji 13 punktów (pomp wodnych) w Soho.
Mapa streets zawiera informacje o położeniu linii (ulic) w Soho.
Po zaimportowaniu powyższych plików kształtów SHP, możemy każdy z nich obejrzeć i edytować w Menadżerze map.
By przeprowadzić analizę zaznaczamy mapę deaths i wykonujemy Przestrzenne statystyki opisowe. Ponieważ jako dane do analizy posłużą nam współrzędne mapy, w oknie statystyk opisowych zaznaczamy opcję Pobierz współrzędne punktów z mapy, jako rodzaj obwiedni obiektów wybieramy otoczkę wypukłą.
Pole powierzchni, w którym znajdują się punkty (określone przez otoczkę wypukłą) wynosi 0.257531km2. Możemy je wyrysować na mapie uruchamiając przycisk i wybierając warstwę obwiedni obiektów.
Na 1000m2 przypada ponad 2 punkty (gęstość=0.002244 punktów na m2).
Analiza macierzy odległości punktów pozwala na dokładniejszą ocenę ich gęstości. Niektóre punkty znajdują się w tym samym miejscu, ponieważ najmniejsza odległość to 0m. Są też punkty znacznie bardziej oddalone od siebie – największa odległość to 662.896352m. Znajdujemy tu również informację o przeciętnej odległości i o ich odchyleniu standardowym.
Najbardziej interesującą informację w przypadku analizy mapy deaths daje zlokalizowane Centrum rozkładu punktów (703.79, 631.65) wraz z obszarem odchyleń standardowych, które opisują stopień koncentracji oraz kierunek dyspersji (okrąg, elipsa, prostokąt).
Elipsę odchyleń standardowych oraz Centrum wyrysujemy ponownie przechodząc do menadżera map (na liście warstw odznaczamy obwiednię obiektów).
Snow przeprowadził rozmowy z mieszkańcami okolicy i zaczął podejrzewać, że źródłem epidemii może być woda. Połączenie wszystkich trzech map pozwala na zidentyfikowanie pompy wodnej, z której woda okazała się być przyczyną epidemii. By to zrobić w Menadżerze map wyświetlamy najpierw mapę streets a następnie poprzez przycisk nanosimy na nią mapę deaths i pumps.
Źródłem epidemii okazuje się być pompa wodna przy ulicy Broad Street (możemy wyświetlić jej etykietę w menadżerze map). Jest to jedyna pompa, która znalazła się w zaznaczonym eliptycznym obszarze, a jej położenie (678.85, 633.27) i położenie środka elipsy (703.79, 631.65), czyli miejsca wokół którego skoncentrowane są zgony, jest bardzo bliskie.